Daži cilvēki apgalvo, ka ASV valdība rīkoja uzbrukumus vai zināja par tiem un pieļāva notikušo. Un šie meli ir saistīti ar jaunāko interneta kustību pārliecību, ka globālā elite plāno ierobežot pilsoņu brīvības, reaģējot uz uzbrukumiem, un veicināt autoritāras pasaules valdības izveidi.
Piemēram, "QAnon", kuras sekotāji uzskata, ka par uzbrukumiem ir atbildīga ASV, ir spējusi šo pieņēmumu izplatīt lielai auditorijai.
Tāpat internetā plaši tiek izplatīts apgalvojums, ka reaktīvā degviela nevarot izkausēt tērauda sijas. Teorijas piekritēji norāda, ka Dvīņu torņus sagrāva iepriekš ievietoti spridzekļi.
Šādas teorijas piekritēji uzskata, ka ēkas iznīcināja ar kontrolētu spridzekļu palīdzību, kuri celtnēs bija ievietoti iepriekš. Lidmašīnu ietriekšanās Dvīņu torņos tos aktivizēja, izraisot lielu eksploziju. Konspirācijas teoriju piekritēji, analizējot situāciju, pauž, ka lidmašīnas degviela nevar radīt pietiekami augstu temperatūru, lai izraisītu tērauda konstrukcijas sagrūšanu.
Šīs spekulācijas papildina arī aculiecinieku versijas par to, ka ēkas sagruva pārāk ātri un vienmērīgi, kas arī liecinātu par sprādziena esamību.
Zīmīgi, ka pat specializētais izdevums "Open Chemical Physics Journal" 2009. gadā ziņoja par tirdzniecības centra debesskrāpju gruvešos atrastām ļoti iedarbīgu sprāgstvielu pēdām. Tiesa, šie apgalvojumi ir pretrunā ar oficiālo izmeklēšanas versiju, un tie līdz galam nav pierādīti.
Taču saskaņā ar oficiālo ziņojumu avarējusī lidmašīna būtiski sabojāja torņu atbalsta kolonnas. Aviokatastrofa izraisīja tērauda siju deformāciju un ēku sabrukšanu.
